Die interne Maiezyt-Schule, die interdisziplinär eng mit den Wohngruppen und der Heimleitung zusammenarbeitet, unterrichtet nach dem Bernischen Lehrplan der Volksschule.
Die dreistufige Schule, bestehend aus Klassen mit 6-9 SchülerInnen ist stark individualisiert, insbesondere in Sprache und Mathematik. Auf die speziellen Ressourcen und Leistungsschwächen wird mit Einzelunterricht, individuellen Lernprogrammen und Beurteilungen Rücksicht genommen. Neben dem Leistungsaspekt ist das Erlernen von Sozialkompetenz auch in der Schule zentral. Da viele der SchülerInnen im Berufsleben manuelle Tätigkeiten ausführen werden, besuchen sie sowohl das textile wie auch das technische Gestalten.
Im Maiezyt kommt der Musik grosse Bedeutung zu; die meisten Kinder erlernen ein Instrument und spielen im Kinderbands. Ab der Mittelstufe erlernen die SchülerInnen das 10-Finger-System und den Umgang mit dem PC. Ab der 8. Klasse begleitet ein Berufsberater die Berufswahl der Jugendlichen. Neben den internen Kindern besuchen auch vier externe SchülerInnen die Maiezytschule. Um die Aussenkontakte zu stärken, gehen die SchülerInnen ab der 6. Klasse ins Turnen und den hauswirtschaftlichen Unterricht der Regelschule in Wabern.